Matlab保存NII文件及读取NII格式医学影像CT数据

最近想用LiTS- Liver Tumor Segmentation Challenge的数据集做些事情，下载数据后发现是nii格式的，使用imageJ可以直接读取并且显示还可以进行3D渲染，但是要做处理的话还是需要用matlab或者python进行读取。

matlab读取方法：

使用Tools for NIfTI and ANALYZE image工具包，下载地址如下：

https://cn.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/8797-tools-for-nifti-and-analyze-image?s_tid=srchtitle

将工具包解压到MATLAB的路径下，解压后的文件名字为NIfTI_20140122，其实可以是任意路径，然后如如下语句即可读取

addpath(‘https://www.gofarlic.com\MATLAB\NIfTI_20140122’)

info  = load_nii (‘test-volume-68.nii’);

image = info.img;

python读取方法：

使用PyNIfTI包，官网地址如下：http://niftilib.sourceforge.net/pynifti/examples.html#loading-and-saving-nifti-files

使用命令即可安装：

apt-get install python-nifti

使用代码：

from nifti import*

nim=NiftiImage(‘example4d.nii’)

print nim.filename

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