工具分为四个模块：BAM和bigWig文件处理、质量控制、热图和其他描述性作图、其他。当然也可以简单分为两个部分：数据处理和可视化。 deeptools三大功能： Tools

UG（Unigraphics NX）是一个交互式CAD/CAM(计算机辅助设计与计算机辅助制造)系统，它功能强大，可以轻松实现各种复杂实体及造型的建构，集成产品设计、工程与制造于一体的解决方案，包含世界上最强大、最广泛的产品设计应用模块，具有高性能的机械设计和制图功能，为制造设计提供了高性能和灵活性，以满足客户设计任何复杂产品的需要...

PowerMILL是一款加工策略丰富的数控加工编程软件系统，采用全新的中文WINDOWS用户界面，提供完善的加工策略。

Mastercam是一款高效专业的实用型CAD/CAM设计辅助工具，集二维绘图、三维实体造型、曲面设计、体素拼合、数控编程、刀具路径模拟及真实感模拟等多种功能于一身，能够帮助用户轻松设计各种复杂的曲线、曲面零件、

Inventor是一款专业的三维可视化实体建模软件，Inventor主要用于各类二维机械制图、三维制图的设计和开发等操作，可以广泛地应用于零件设计、钣金设计、装配设计等领域。

CATIA是一款模块化的旗舰解决方案软件，作为一个完全集成化的软件系统，可提供产品的风格和外型设计、机械设计、设备与系统工程、管理数字样机、机械加工、分析和模拟。

SolidWorks是一款专业的三维3D设计软件，功能强悍，支持分布式数据管理，支持直接处理网格数据，提供更多的数据的灵活性，使用起来高效便捷...

它包含了所有的NURBS建模功能，用它建模感觉非常流畅，所以大家经常用它来建模，然后导出高精度模型给其他三维软件使用。

Pro/Engineer是一款CAD/CAM/CAE一体化的三维软件，以参数化著称，是参数化技术的最早应用者，在三维造型软件领域中占有着重要地位。

CAD是一款可视化的二维和三维绘图软件，许多命令和操作可以通过菜单选项和工具按钮等多种方式实现，可以用来完成任何设计，包括二维绘图、详细绘制、设计文档和基本三维设计，能够应用于机械设计、工业制图、工程制图

通用 CFD软件包，用来模拟从不可压缩到高度可压缩范围内的复杂流动。由于采用了多种求解方法和多重网格加速收敛技术，因而FLUENT能达到最佳的收敛速度和求解精度。

软件概述　　 作为功能强大的CAE前处理软件，ANSA与国际主流的三维设计软件通用求解器具有非常方便的数据接口...

ABAQUS 是一套功能强大的工程模拟的有限元软件，其解决问题的范围从相对简单的线性分析到许多复杂的非线性问题。 ABAQUS 包括一个丰富的、可模拟任意几何形状的单元库。

法国达索系统公司开发的CATIA就是其中最成功的设计软件之一。 自1978年问世以来，CATIA已成为全球最权威的三维设计软件，广泛应用于航空、汽车、造船、机械、电子、电器等各个领域...

UG软件盗版 UG（Unigraphics NX）是Siemens PLM Software公司出品的一个产品工程解决方案，它为用户的产品设计及加工过程提供了数字化造型和验证手段。

由于西门子的TC系统在软件实施和许可购买成本上的费用都很高，市面上也相继出现了TC软件盗版...

solidworks软件盗版 SolidWorks简称SW，是达索系统（Dassault Systemes ）下的子公司，专门负责研发与销售机械设计软件的视窗产品，公司总部位于美国马萨诸塞州。

MSC软件盗版 MSC是一款可以完成结构静力学分析，包括强度、刚度分析、模态分析及屈曲分析的软件。可对多种单元、材料、载荷工况进行评估。

大部分公司或者个人都愿意使用EPLAN盗版软件，而正是因为盗版软件被使用，影响了正版产品的利益，因此就有很多查盗版软件的案件发生。所以...

Creo软件盗版 Pro/Engineer操作软件（又简称ProE）是美国参数技术公司（PTC)旗下的CAD/CAM/CAE一体化的三维软件，Creo是美国PTC公司于2010年10月推出CAD设计软件包